يقتصر مهمة مصلحة الجمارك على تطبيق القوانين واللوائح الجمركية، وغيرها من القوانين والقرارات ذات الصلة لتحديد قيمة الضرائب أو الرسوم.

فالضريبة الجمركية يصدر بها قرار رئيس الجمهورية وذلك بإصدار التعريفة الجمركية محدد بها بيان بنسبة الضرائب الجمركية لكل بند على حدى  كل خمس سنوات.

اما الضريبة الجمركية على السجائر فهى ضريبة نوعية على حسب الوزن، وهي ثابتة نسبيًا حيث  تبلغ ١٠٠ جنيه على كل كجم، ومتوسط وزن علبة السجائر ١٨ جرام، علما بإنه ا لم تتغير منذ فترة كبيرة.

اما ضريبة القيمة المضافة فتخضع السجائر بقيم متدرجة، والتي ترتبط بسعر البيع طبقا لقانون القيمة المضافة رقم ١٧٧ لسنة ٢٠٢٣ وهي كالتالي:
٤ جنيه للسجائر اقل من ٣١ جنيه
٧ جنيه للسجائر من ٣١ إلى ٤٥ جنيه
٧.٥ جنيه للسجائر التي يبلغ سعرها أكثر من ٤٥ جنيه.

وتفرض رسوم إضافية على السجائر مثل دعم الطلبة ١٠ قروش على كل علبة سجائر٬ تامين صحي ١.٥ لكل علبة سجائر٬ أرباح تجارية وصناعية ١ ٪.

اما العوامل المؤثرة في تغير سعر بيع السجائر فيكون الأساس السعر الأساسي الذي يحدده المنتج أو المستورد يؤثر بشكل كبير على السعر النهائي للمستهلك.

وقد يكون للأزمات العالمية، وارتفاع أسعار النقل(النولون)، والتضخم، تأثير على تكلفة الإنتاج والاستيراد.

وأيضا قد يلجأ بعض التجار إلى تخزين السجائر لرفع الأسعار.

فمصلحة الجمارك المصرية تختص فقط  في تنفيذ القرارات والقوانين وتحصيل الضرائب والرسوم للعديد من الجهات والمصالح مثل (جهات العرض – مصلحة الضرائب – الدمغة والموازين) وذلك دون التدخل في تحديد فئات أو قيمة هذه الضرائب أو الرسوم.